Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf2P23906 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf2P23906 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf2P23906 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf2P23906 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms