Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrphP15331 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrphP15331 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrphP15331 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrphP15331 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrphP15331 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrphP15331 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrphP15331 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrphP15331 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrphP15331 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrphP15331 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PrphP15331 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrphP15331 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrphP15331 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrphP15331 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrphP15331 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrphP15331 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrphP15331 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrphP15331 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrphP15331 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrphP15331 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrphP15331 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrphP15331 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrphP15331 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrphP15331 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PrphP15331 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrphP15331 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrphP15331 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrphP15331 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrphP15331 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrphP15331 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrphP15331 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrphP15331 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrphP15331 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrphP15331 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrphP15331 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrphP15331 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrphP15331 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrphP15331 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrphP15331 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrphP15331 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrphP15331 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrphP15331 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrphP15331 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrphP15331 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrphP15331 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrphP15331 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrphP15331 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrphP15331 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrphP15331 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrphP15331 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrphP15331 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrphP15331 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrphP15331 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrphP15331 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrphP15331 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrphP15331 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrphP15331 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrphP15331 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrphP15331 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrphP15331 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrphP15331 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrphP15331 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrphP15331 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrphP15331 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrphP15331 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PrphP15331 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrphP15331 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrphP15331 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrphP15331 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrphP15331 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrphP15331 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms