Protein–RNA interactions for Protein: P10124

SRGN, Serglycin, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGNP10124 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGNP10124 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGNP10124 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGNP10124 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGNP10124 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGNP10124 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGNP10124 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGNP10124 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGNP10124 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGNP10124 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGNP10124 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGNP10124 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGNP10124 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGNP10124 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGNP10124 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGNP10124 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGNP10124 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGNP10124 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGNP10124 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGNP10124 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGNP10124 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGNP10124 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGNP10124 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGNP10124 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGNP10124 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGNP10124 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGNP10124 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGNP10124 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGNP10124 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGNP10124 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGNP10124 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SRGNP10124 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGNP10124 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGNP10124 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGNP10124 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGNP10124 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGNP10124 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGNP10124 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGNP10124 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGNP10124 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGNP10124 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGNP10124 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGNP10124 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGNP10124 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGNP10124 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGNP10124 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGNP10124 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGNP10124 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGNP10124 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGNP10124 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGNP10124 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGNP10124 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGNP10124 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGNP10124 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGNP10124 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGNP10124 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGNP10124 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGNP10124 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGNP10124 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGNP10124 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGNP10124 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGNP10124 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGNP10124 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGNP10124 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGNP10124 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGNP10124 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGNP10124 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms