Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms