Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01748 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01748 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01748 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01748 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01748 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01748 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01748 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01748 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01748 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01748 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01748 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01748 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01748 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01748 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms