Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme6O88425 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme6O88425 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme6O88425 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme6O88425 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme6O88425 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms