Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 722.8 ms