Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FiglaO55208 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FiglaO55208 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FiglaO55208 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms