Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja1O55176 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja1O55176 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja1O55176 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pja1O55176 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Pja1O55176 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pja1O55176 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pja1O55176 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pja1O55176 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms