Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc3O55013 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms