Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf18O35714 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfrsf18O35714 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms