Protein–RNA interactions for Protein: O35648

Cetn3, Centrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn3O35648 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cetn3O35648 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cetn3O35648 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms