Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLRMTO00411 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms