Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp17lcG5E8I7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17lcG5E8I7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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