Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gm20521D3Z5F7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm20521D3Z5F7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm20521D3Z5F7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gm20521D3Z5F7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gm20521D3Z5F7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gm20521D3Z5F7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm20521D3Z5F7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm20521D3Z5F7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms