Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4D4

1700064H15Rik, RIKEN cDNA 1700064H15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700064H15RikD3Z4D4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700064H15RikD3Z4D4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700064H15RikD3Z4D4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700064H15RikD3Z4D4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms