Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms