Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms