Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms