Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.465e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.425e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.45e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 UBA2-203ENST00000586313 1458 ntTSL 217.36■□□□□ 0.375e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.315e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.35e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 SLC39A13-211ENST00000531865 846 ntTSL 516.48■□□□□ 0.235e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ZNF219-205ENST00000553980 576 ntTSL 416.39■□□□□ 0.215e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 SLC39A13-209ENST00000529740 558 ntTSL 216.26■□□□□ 0.195e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 SLC39A13-205ENST00000526614 827 ntTSL 515.85■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 NOL6-205ENST00000464829 1829 ntTSL 215.84■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ZNF219-208ENST00000555270 798 ntTSL 415.63■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.055e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 PROX1-204ENST00000471129 900 ntTSL 315.36■□□□□ 0.055e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ZNF219-204ENST00000553296 560 ntTSL 215.19■□□□□ 0.025e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 HMGCS1-206ENST00000511774 500 ntTSL 415.18■□□□□ 0.025e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 GGA2-208ENST00000566685 571 ntTSL 414.79□□□□□ -0.043e-14■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ZNF219-212ENST00000556944 609 ntTSL 414.57□□□□□ -0.085e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.145e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.185e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.185e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ZNF219-211ENST00000556174 546 ntTSL 413.8□□□□□ -0.25e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 AKAP1-214ENST00000575032 570 ntTSL 313.8□□□□□ -0.25e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ZNF219-207ENST00000554923 567 ntTSL 413.73□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 NOL6-201ENST00000297990 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.62□□□□□ -0.235e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 UBA2-205ENST00000590048 847 ntTSL 313.43□□□□□ -0.265e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 TNFRSF10B-203ENST00000518531 564 ntTSL 313.14□□□□□ -0.313e-14■□□□□ 8
SF3A3Q12874 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ZNF219-206ENST00000554478 545 ntTSL 412.81□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 HMGCS1-203ENST00000507004 950 ntTSL 212.29□□□□□ -0.445e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ZNF219-209ENST00000555697 654 ntTSL 212.01□□□□□ -0.495e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 RETSAT-202ENST00000409984 765 ntTSL 211.98□□□□□ -0.495e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.585e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.613e-14■□□□□ 8
SF3A3Q12874 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 NOL6-202ENST00000353159 3411 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 HMGCS1-204ENST00000507293 708 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.845e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 PROX1-206ENST00000607425 560 ntTSL 39.79□□□□□ -0.845e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 UBA1-209ENST00000490869 917 ntTSL 29.42□□□□□ -0.95e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 PNN-203ENST00000554117 624 ntTSL 29.2□□□□□ -0.945e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 39.03□□□□□ -0.963e-14■□□□□ 8
SF3A3Q12874 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.055e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.075e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.095e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.165e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.195e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.215e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ANKRD10-208ENST00000485844 641 ntTSL 27.12□□□□□ -1.275e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 AC097478.1-205ENST00000507916 602 ntTSL 37.01□□□□□ -1.295e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ANKRD10-211ENST00000603993 704 ntTSL 26.94□□□□□ -1.35e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ANKHD1-218ENST00000506755 522 ntTSL 36.25□□□□□ -1.413e-14■□□□□ 8
SF3A3Q12874 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.16□□□□□ -1.425e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.495e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 CYTH2-212ENST00000600597 293 ntTSL 55.56□□□□□ -1.525e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.525e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 55.18□□□□□ -1.585e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 AC097478.1-201ENST00000506864 560 ntTSL 45.04□□□□□ -1.65e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 MAPK1-203ENST00000491588 491 ntTSL 24.46□□□□□ -1.75e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 ZNF219-210ENST00000556101 475 ntTSL 44.33□□□□□ -1.725e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.785e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 MLLT10-206ENST00000420525 538 ntTSL 33.4□□□□□ -1.875e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 CCDC93-209ENST00000488908 268 ntTSL 52.81□□□□□ -1.965e-6■□□□□ 8
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