Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F8a1Q00558 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms