Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RxraP28700 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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