Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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