Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rrn3B2RS91 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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