Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms