Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

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Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Lrig1P70193 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrig1P70193 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms