Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms