Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms