Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pou4f1P17208 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms