Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Q1O19441 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Q1O19441 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-Q1O19441 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-Q1O19441 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-Q1O19441 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-Q1O19441 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-Q1O19441 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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H2-Q1O19441 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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