Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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