Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms