Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vsnl1P62761 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms