Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLD1P28340 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms