Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms