Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms