Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sec31aQ3UPL0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms