Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
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