Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rps3-205ENSMUST00000208532 489 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AC159293.1-201ENSMUST00000222662 545 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Trpm3-205ENSMUST00000099566 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm11518-201ENSMUST00000118048 411 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm6341-201ENSMUST00000119683 411 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gsta3-201ENSMUST00000027067 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms