Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms