Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140 ms