Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYT1P21579 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYT1P21579 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYT1P21579 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYT1P21579 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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