Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Jade1-206ENSMUST00000191952 3327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm44095-201ENSMUST00000204631 1931 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm42856-201ENSMUST00000200848 2852 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ptger2-201ENSMUST00000046891 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gpkow-201ENSMUST00000049896 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mboat2-202ENSMUST00000110942 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tgfb1i1-204ENSMUST00000164710 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ttc16-201ENSMUST00000066478 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zmiz2-203ENSMUST00000109785 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Lpin3-202ENSMUST00000109455 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Muc2-201ENSMUST00000026590 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cln3-202ENSMUST00000084589 3203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms