Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nek4Q9Z1J2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms