Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sumo3Q9Z172 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms