Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms