Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trex2Q9R1A9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms