Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra1Q9R118 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms