Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod1Q9R0E2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod1Q9R0E2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms