Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad9Q9JIW5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad9Q9JIW5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms